قام الباحثون بتقييم إمكانات الأمن الحيوي للنماذج الأساسية للجينوم من خلال تدريب مسحات خطية ومسحات انتباه على تنشيطات الطبقة-26 المجمدة لـ Evo 2 لفحص مقاومة المضادات الميكروبية (AMR) في البيانات الميتاجينومية. وجدت الدراسة أن هذه المسحات الخفيفة يمكنها اكتشاف AMR بتمييز قوي، محققةً منطقة ROC-AUC بنسبة 0.977 باستخدام مسحة انتباه برأس واحد.
- حققت المسحات الخطية منطقة ROC-AUC بنسبة 0.888، بينما حسنت مسحات الانتباه برأس واحد هذا إلى 0.977.
- تحل المسحات فئات فرعية أدوية AMR ذات دقة أدق وتفصلها عن الجينات الوظيفية غير ذات الصلة.
- كانت ضراوة البكتيريا قابلة للفك أيضًا، وإن كان بشكل أضعف، بمنطقة ROC-AUC بنسبة 0.833.
- حافظت مسحة AMR على أداء ترتيب قابل للمقارنة على القراءات القصيرة المحاكية دون إعادة تدريب، محققةً قراءة ROC-AUC بنسبة 0.898.
- داخل SynGenome، كانت تسميات المطالبة المرتبطة بـ AMR قابلة للاسترداد بشكل ضعيف فقط من التسلسلات المولدة بواسطة Evo 1.5.
تضع هذه النتائج المسحات القائمة على التضمين كطبقة كشف سريعة ومنخفضة التكلفة للمراقبة الحيوية الميتاجينومية، مما يحدد نقاط القوة والحدود لاستخدام تمثيلات النماذج الأساسية لفحص الأمن الحيوي.