शोधकर्ताओं ने जीनोमिक फाउंडेशन मॉडल्स की बायोसिक्योरिटी क्षमता का आकलन किया, जिन्होंने मेटाजेनोमिक डेटा में प्रतिजैविक प्रतिरोध (AMR) के लिए स्क्रीनिंग करने के लिए जमे हुए Evo 2 लेयर-26 सक्रियणों पर रैखिक और एटेंशन प्रोब्स को प्रशिक्षित किया। अध्ययन से पता चला कि ये हल्के प्रोब्स AMR को मजबूत विभेदन के साथ पहचान सकते हैं, जिसमें एक सिंगल-हेड एटेंशन प्रोब का उपयोग करके क्षेत्र-स्तर ROC-AUC 0.977 प्राप्त हुआ।
- रैखिक प्रोब्स ने क्षेत्र-स्तर ROC-AUC 0.888 हासिल किया, जबकि सिंगल-हेड एटेंशन प्रोब्स ने इसे बढ़ाकर 0.977 कर दिया।
- प्रोब्स बारीक-स्तर के AMR दवा-श्रेणी उप-श्रेणियों को हल करते हैं और उन्हें असंबंधित कार्यात्मक जीनों से अलग करते हैं।
- बैक्टीरियल वायरुलेंस भी डिकोडेबल था, हालांकि कमजोर रूप में, जिसमें क्षेत्र-स्तर ROC-AUC 0.833 था।
- AMR प्रोब ने बिना पुनः प्रशिक्षण के सिमुलेटेड शॉट रीड्स पर तुलनीय रैंकिंग प्रदर्शन बनाए रखे, जिसमें रीड-स्तर ROC-AUC 0.898 प्राप्त हुआ।
- SynGenome के भीतर, AMR-संबंधित प्रॉम्प्ट लेबल्स Evo 1.5-जनरेटेड अनुक्रमों से केवल कमजोर रूप में पुनः प्राप्त किए जा सकें।
ये परिणाम एम्बेडिंग-आधारित प्रोब्स को मेटाजेनोमिक बायोसर्विलेंस के लिए एक तेज़, सस्ती फर्स्ट-पास डिटेक्शन परत के रूप में स्थापित करते हैं, जो बायोसिक्योरिटी स्क्रीनिंग के लिए फाउंडेशन मॉडल प्रतिनिधित्वों का उपयोग करने की ताकत और सीमाओं को मानचित्रित करते हैं।